- Build/Test information:
- Build directory: .
- Parallel run
- Files:
- Dimensionality: 2
- Compilation:
Successful
- Compilation time: 1.039 s
- Compilation command:
cmake --build /home/regtester/git/ExaEpi/builddir -j 8 -- agent
- make output
- Execution:
- Execution time: 123.060 s
- 5 run average: 125.121 s
- Relative performance: 1.6% faster
- Execution command:
mpiexec -n 1 ./CA_July4.ex inputs.ca amr.plot_file=CA_July4_plt amr.check_file=CA_July4_chk amr.checkpoint_files_output=0 agent.census_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CensusData/CA.dat" agent.workerflow_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CensusData/CA-wf.bin" disease.case_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CaseData/July4.cases" agent.plot_int=120 agent.air_travel_int=-1
- execution output
- execution stderr
- Comparison:
/home/regtester/git/amrex/Tools/Plotfile//fcompare.gnu.ex --abort_if_not_all_found -n 0 /home/regtester/RegTesting/rt-ExaEpi/ExaEpi-GPU-benchmarks/plt00120 plt00120
| variable name | absolute error | relative error |
|---|
| | (||A - B||) | (||A - B||/||A||) |
|---|
| level = 0 |
| total | 0.0 | 0.0 |
| never_infected | 238.0 | 0.2069565217 |
| infected | 23.0 | 7.666666667 |
| immune | 246.0 | 0.1230615308 |
| susceptible | 0.0 | 0.0 |
| new_cases | 1.0 | inf |
| FIPS | 0.0 | 0.0 |
| Tract | 0.0 | 0.0 |
| comm | 0.0 | 0.0 |
| unit | 0.0 | 0.0 |
diff -r /home/regtester/RegTesting/rt-ExaEpi/ExaEpi-GPU-benchmarks//CA_July4_output.dat output.dat
3,121c3,121
< 1 33947185 44477 0 0 36 16 6 38782 2271 3377 47
< 2 33384556 607106 0 0 435 147 30 583710 9376 12149 1871
< 3 32274009 1717652 1 0 1964 672 144 1587798 52028 67235 10591
< 4 32211950 1779692 18 2 9632 3202 633 1248035 213864 267606 50187
< 5 32106352 1884978 329 3 38531 13060 2636 733462 461883 455290 234343
< 6 31912026 2076743 2872 21 89508 30475 6295 493310 634838 347240 601355
< 7 31639548 2333971 17962 181 134537 45992 9672 532763 723827 174044 903337
< 8 31278065 2630280 82505 812 146335 50295 10540 700652 782877 133946 1012805
< 9 30780556 2944877 264292 1937 134328 46713 9826 954080 816018 172196 1002583
< 10 30109410 3272137 607210 2905 128446 44941 9589 1294940 807696 236625 932876
< 11 29242619 3706991 1038662 3390 139929 49221 10613 1712499 800906 321037 872549
< 12 28160435 4405451 1422033 3743 158237 55542 11929 2192161 874250 431541 907499
< 13 26844823 5432882 1709540 4417 170082 59317 12754 2724083 1066430 563642 1078727
< 14 25293962 6739219 1952834 5647 172781 59752 12819 3284548 1366404 712247 1376020
< 15 23525727 8242740 2215804 7391 174800 60028 12791 3841393 1747013 876322 1778012
< 16 21572920 9860659 2548396 9687 180171 61355 13078 4356719 2189400 1042326 2272214
< 17 19495865 11488031 2995231 12535 186725 63412 13430 4775158 2672273 1204347 2836253
< 18 17369258 13018043 3588632 15729 195401 66010 14000 5052867 3174587 1346496 3444093
< 19 15288980 14323348 4360333 19001 207761 69802 14786 5142503 3661458 1455260 4064127
< 20 13334277 15303698 5331314 22373 224099 75061 15811 5025503 4102770 1515201 4660224
< 21 11575986 15873160 6516827 25689 246637 82834 17347 4717578 4452181 1516859 5186542
< 22 10058760 15984380 7919667 28855 273608 92042 19431 4252710 4684360 1456796 5590514
< 23 8792090 15636024 9531548 32000 305134 103055 21864 3692703 4768330 1345316 5829675
< 24 7759206 14869232 11327774 35450 336740 114306 24306 3108584 4693288 1193386 5873974
< 25 6929023 13761806 13261570 39263 366961 125159 26840 2556339 4467081 1023002 5715384
< 26 6270122 12408093 15269816 43631 393488 135071 29056 2065955 4119204 849790 5373144
< 27 5746708 10912109 17284158 48687 413410 142799 31055 1651078 3681111 693264 4886656
< 28 5329876 9378341 19228763 54682 424587 147075 32068 1316507 3196505 556878 4308451
< 29 4995073 7903780 21031439 61370 427766 148514 32407 1050919 2708108 442851 3701902
< 30 4725209 6554140 22643511 68802 421694 146715 32005 841872 2247993 353289 3110986
< 31 4506665 5368435 24039662 76900 406550 141674 30834 678121 1836822 282033 2571459
< 32 4328193 4361714 25216432 85323 384287 133980 29251 549022 1484838 227045 2100809
< 33 4180066 3532202 26185372 94022 355960 123979 27047 449115 1193119 183044 1706924
< 34 4057822 2859279 26971942 102619 323793 112576 24571 369828 957173 148446 1383832
< 35 3956722 2319421 27604769 110750 289629 100766 21977 305250 769702 122370 1122099
< 36 3871827 1889249 28112256 118330 255182 88861 19503 253879 621423 100771 913176
< 37 3800612 1546655 28519064 125331 222568 77449 16989 211581 504496 83503 747075
< 38 3741192 1271834 28847121 131515 192024 66784 14708 177159 412225 69422 613028
< 39 3691041 1051040 29112615 136966 164565 57185 12530 148701 338588 58330 505421
< 40 3648699 872407 29328807 141749 140637 49036 10722 125055 279386 48697 419269
< 41 3612808 726568 29506448 145838 119410 41853 9138 105600 231743 40768 348457
< 42 3582391 607648 29652356 149267 101849 35618 7780 89202 193214 34505 290727
< 43 3556641 509295 29773511 152215 86388 30205 6574 75489 161631 29072 243103
< 44 3534715 428823 29873397 154727 73391 25657 5567 64270 135881 24502 204170
< 45 3516049 361285 29957494 156834 62655 21900 4716 54446 114117 20784 171938
< 46 3500123 305708 30027197 158634 53393 18613 4024 46496 96375 17576 145261
< 47 3486566 258625 30086325 160146 45569 15860 3428 39391 81568 15137 122529
< 48 3475044 219334 30135832 161452 39045 13550 2889 33490 68993 12839 104012
< 49 3465141 186261 30177709 162551 33509 11699 2469 28627 58526 10866 88242
< 50 3456526 158657 30213029 163450 28826 10088 2150 24639 49846 9274 74898
< 51 3449251 135159 30243010 164242 24625 8560 1831 21141 42522 7882 63614
< 52 3443006 115380 30268396 164880 21137 7372 1592 18163 36298 6797 54122
< 53 3437672 98469 30290046 165475 18164 6284 1333 15525 30961 5901 46082
< 54 3433046 84315 30308320 165981 15703 5396 1136 13316 26530 4955 39514
< 55 3429165 72053 30324039 166405 13609 4642 993 11439 22607 4325 33682
< 56 3425812 61528 30337536 166786 11674 3965 841 9728 19366 3636 28798
< 57 3422870 52851 30348876 167065 10190 3485 736 8333 16558 3162 24798
< 58 3420386 45455 30358497 167324 8848 3069 652 7192 14195 2633 21435
< 59 3418198 39061 30366860 167543 7647 2665 591 6290 12257 2256 18258
< 60 3416347 33637 30373946 167732 6541 2320 524 5458 10516 1956 15707
< 61 3414749 28849 30380143 167921 5570 1981 466 4640 9053 1663 13493
< 62 3413401 24720 30385468 168073 4800 1696 382 3903 7779 1511 11527
< 63 3412174 21251 30390026 168211 4116 1453 329 3437 6654 1228 9932
< 64 3411147 18258 30393946 168311 3542 1242 281 2944 5695 1076 8543
< 65 3410250 15655 30397354 168403 2989 1034 239 2574 4944 932 7205
< 66 3409424 13605 30400143 168490 2542 864 188 2305 4265 794 6241
< 67 3408805 11738 30402554 168565 2239 756 157 1907 3727 705 5399
< 68 3408235 10123 30404690 168614 1912 657 139 1645 3206 572 4700
< 69 3407773 8712 30406513 168664 1703 573 124 1382 2759 506 4065
< 70 3407330 7523 30408098 168711 1470 485 99 1222 2415 416 3470
< 71 3406955 6484 30409472 168751 1230 409 89 1066 2138 353 2927
< 72 3406636 5630 30410620 168776 1058 366 82 900 1857 355 2518
< 73 3406361 4826 30411673 168802 922 318 68 776 1559 313 2178
< 74 3406096 4181 30412549 168836 761 248 47 686 1364 254 1877
< 75 3405851 3686 30413266 168859 682 230 41 645 1172 224 1645
< 76 3405678 3168 30413936 168880 572 197 32 575 979 199 1415
< 77 3405521 2749 30414503 168889 495 167 31 444 857 198 1250
< 78 3405386 2418 30414959 168899 468 158 28 384 752 154 1128
< 79 3405272 2080 30415402 168908 414 140 26 318 639 122 1001
< 80 3405162 1790 30415794 168916 364 126 25 298 552 98 842
< 81 3405071 1569 30416096 168926 328 118 26 267 474 98 730
< 82 3404987 1384 30416360 168931 293 101 26 228 424 76 656
< 83 3404915 1198 30416613 168936 264 95 26 197 364 66 571
< 84 3404858 1030 30416832 168942 225 84 21 169 303 64 494
< 85 3404803 882 30417024 168953 189 67 14 149 265 54 414
< 86 3404751 772 30417182 168957 159 57 13 124 241 51 356
< 87 3404709 686 30417304 168963 142 48 8 113 214 46 313
< 88 3404669 614 30417413 168966 118 39 7 109 195 33 277
< 89 3404634 537 30417519 168972 105 39 5 93 172 25 247
< 90 3404610 459 30417619 168974 89 38 6 72 158 32 197
< 91 3404578 413 30417696 168975 80 30 5 72 137 37 167
< 92 3404560 353 30417773 168976 68 29 6 62 117 20 154
< 93 3404537 304 30417845 168976 57 25 5 60 95 15 134
< 94 3404527 263 30417895 168977 55 25 6 48 79 11 125
< 95 3404508 239 30417935 168980 48 20 4 44 70 11 114
< 96 3404494 214 30417971 168983 38 12 2 37 65 14 98
< 97 3404484 188 30418006 168984 42 14 3 32 55 14 87
< 98 3404474 165 30418039 168984 36 13 3 33 47 7 78
< 99 3404467 145 30418064 168986 28 9 2 25 46 8 66
< 100 3404456 130 30418089 168987 24 9 1 24 42 6 58
< 101 3404446 109 30418119 168988 20 6 1 20 39 5 45
< 102 3404440 99 30418135 168988 21 7 1 17 36 8 38
< 103 3404431 96 30418147 168988 19 8 1 17 36 7 36
< 104 3404425 89 30418159 168989 16 7 0 16 35 5 33
< 105 3404415 87 30418171 168989 14 7 0 21 33 4 29
< 106 3404411 77 30418184 168990 13 7 0 19 27 5 26
< 107 3404409 66 30418197 168990 9 6 0 9 29 7 21
< 108 3404404 59 30418209 168990 6 5 0 8 23 7 21
< 109 3404396 56 30418219 168991 6 4 0 14 18 5 19
< 110 3404392 54 30418223 168993 4 2 0 15 18 0 21
< 111 3404388 49 30418231 168994 4 1 0 15 15 3 16
< 112 3404388 40 30418239 168995 4 0 0 6 12 5 17
< 113 3404386 34 30418247 168995 3 0 0 4 13 2 15
< 114 3404385 30 30418252 168995 4 0 0 3 14 1 12
< 115 3404383 25 30418259 168995 3 0 0 4 10 0 11
< 116 3404381 25 30418261 168995 3 0 0 6 9 0 10
< 117 3404380 23 30418264 168995 2 0 0 5 10 1 7
< 118 3404379 18 30418270 168995 1 0 0 2 9 3 4
< 119 3404377 16 30418274 168995 1 0 0 4 5 2 5
---
> 1 33947185 44477 0 0 25 11 4 38782 2271 3377 47
> 2 33384561 607101 0 0 290 97 23 583706 9375 12149 1871
> 3 32273894 1717767 1 0 1557 525 109 1587889 52029 67258 10591
> 4 32211971 1779674 15 2 9174 3035 603 1247957 213724 267820 50173
> 5 32106457 1884914 288 3 38210 12927 2629 733247 461844 455435 234388
> 6 31912127 2076819 2689 27 89593 30549 6280 493191 634954 347188 601486
> 7 31638994 2334687 17806 175 134690 46022 9529 533404 724020 173961 903302
> 8 31277075 2631516 82168 903 146565 50327 10403 701724 783103 133963 1012726
> 9 30779679 2946140 263844 1999 134478 46714 9831 954612 816550 172151 1002827
> 10 30109255 3272229 607219 2959 128643 45024 9651 1294478 808408 236539 932804
> 11 29242748 3706825 1038622 3467 140000 49139 10545 1711731 800580 321717 872797
> 12 28160993 4404885 1421984 3800 158323 55510 11929 2190946 874533 432118 907288
> 13 26846104 5431276 1709830 4452 169917 59269 12785 2721749 1066687 564439 1078401
> 14 25299881 6732664 1953434 5683 172232 59407 12709 3278613 1365735 713109 1375207
> 15 23536097 8231954 2216247 7364 174635 59786 12745 3832834 1745767 874984 1778369
> 16 21589126 9843063 2549728 9745 179903 61228 13053 4345213 2186634 1039612 2271604
> 17 19517247 11466282 2995480 12653 186777 63256 13441 4763187 2669298 1200172 2833625
> 18 17395236 12989771 3590780 15875 195157 65743 13863 5040493 3169235 1343345 3436698
> 19 15314805 14296933 4360697 19227 207170 69519 14640 5134008 3655980 1452092 4054853
> 20 13359857 15279178 5330068 22559 223634 75104 15858 5022852 4095094 1512681 4648551
> 21 11602256 15849212 6514483 25711 246070 82768 17614 4714029 4447133 1515003 5173047
> 22 10084561 15962934 7915366 28801 273702 92441 19657 4253039 4676175 1457951 5575769
> 23 8817168 15618966 9523584 31944 304738 103207 21907 3693970 4761695 1346544 5816757
> 24 7786626 14855663 11314098 35275 336516 114566 24363 3107701 4689980 1194486 5863496
> 25 6957873 13752295 13242510 38984 366086 125119 26654 2553196 4467381 1023711 5708007
> 26 6296831 12400992 15250544 43295 391884 134338 28760 2064093 4117952 850594 5368353
> 27 5769194 10910926 17263058 48484 412067 142039 30555 1656558 3678876 692871 4882621
> 28 5346978 9386991 19203316 54377 423959 146723 31508 1324394 3197073 557530 4307994
> 29 5008334 7915427 21006717 61184 425968 147702 31827 1059920 2709537 446914 3699056
> 30 4734775 6570413 22617957 68517 420576 146208 31720 851887 2249217 356409 3112900
> 31 4512053 5386502 24016735 76372 406152 141471 30952 687860 1838751 285195 2574696
> 32 4329177 4386993 25190854 84638 384261 134295 29413 559196 1490337 229722 2107738
> 33 4179382 3558419 26160587 93274 356183 124779 27327 456324 1200036 185853 1716206
> 34 4055486 2886843 26947638 101695 323814 113528 24979 375499 965646 151542 1394156
> 35 3953508 2345402 27582905 109847 289787 101662 22467 309239 777573 124256 1134334
> 36 3868732 1912360 28093113 117457 255860 89770 19891 255312 629780 102063 925205
> 37 3797558 1565789 28503785 124530 223038 78272 17346 212103 511557 84997 757132
> 38 3738536 1286484 28835756 130886 192554 67527 14978 176589 417344 70136 622415
> 39 3688856 1060832 29105513 136461 165156 58057 12837 147509 342281 58292 512750
> 40 3647113 878372 29324790 141387 140944 49417 10929 123691 282100 48503 424078
> 41 3611699 730091 29504399 145473 120169 42049 9313 104276 233527 40128 352160
> 42 3581906 608260 29652590 148906 102345 35828 7941 87718 193513 33998 293031
> 43 3556461 507805 29775377 152019 86755 30324 6646 74462 161092 28685 243566
> 44 3535047 426397 29875631 154587 74191 25810 5653 63154 135091 24030 204122
> 45 3516728 358251 29959909 156774 63025 21966 4789 53659 113362 20415 170815
> 46 3501021 301947 30030106 158588 53735 18812 4097 45441 95486 17534 143486
> 47 3487593 255093 30088877 160099 45922 16127 3521 38824 80376 14859 121034
> 48 3476396 215966 30137880 161420 39206 13722 2969 32901 67928 12727 102410
> 49 3466892 183067 30179185 162518 33568 11837 2563 28041 57359 10766 86901
> 50 3458595 155727 30213914 163426 28805 10188 2236 23932 48729 9146 73920
> 51 3451509 132653 30243252 164248 24794 8775 1930 20476 41422 7746 63009
> 52 3445446 112915 30268353 164948 21420 7527 1655 17477 35080 6612 53746
> 53 3440177 96323 30289607 165555 18394 6409 1425 15100 29879 5763 45581
> 54 3435753 82246 30307608 166055 15784 5489 1219 12941 25450 4931 38924
> 55 3431931 70265 30322965 166501 13629 4732 1065 11011 21822 4184 33248
> 56 3428637 60085 30336076 166864 11733 4090 922 9410 18603 3642 28430
> 57 3425800 51695 30346969 167198 10114 3518 779 8098 16094 3077 24426
> 58 3423270 44407 30356509 167476 8679 3007 663 7093 13806 2615 20893
> 59 3421171 38128 30364673 167690 7409 2594 566 6137 11829 2224 17938
> 60 3419272 32906 30371610 167874 6392 2247 502 5276 10270 1973 15387
> 61 3417766 28050 30377779 168067 5390 1897 434 4496 8822 1671 13061
> 62 3416339 24244 30382869 168210 4661 1657 378 3947 7602 1478 11217
> 63 3415188 20852 30387280 168342 4015 1421 319 3421 6580 1202 9649
> 64 3414143 18017 30391055 168447 3440 1210 264 2959 5691 1048 8319
> 65 3413196 15630 30394304 168532 2988 1065 237 2599 4909 919 7203
> 66 3412386 13556 30397100 168620 2607 918 198 2263 4207 819 6267
> 67 3411643 11829 30399487 168703 2298 782 163 2018 3613 746 5452
> 68 3411046 10284 30401573 168759 2012 689 139 1775 3130 645 4734
> 69 3410518 8942 30403389 168813 1719 569 115 1519 2740 549 4134
> 70 3410085 7747 30404980 168850 1498 503 107 1281 2383 489 3594
> 71 3409700 6748 30406331 168883 1325 452 100 1108 2061 425 3154
> 72 3409365 5919 30407462 168916 1179 397 86 937 1827 371 2784
> 73 3409049 5114 30408545 168954 1023 331 63 847 1594 287 2386
> 74 3408805 4436 30409456 168965 897 289 59 739 1373 256 2068
> 75 3408550 3883 30410244 168985 779 248 50 707 1167 221 1788
> 76 3408355 3362 30410939 169006 678 209 45 592 1000 203 1567
> 77 3408204 2917 30411516 169025 589 191 41 451 920 183 1363
> 78 3408054 2539 30412025 169044 514 170 40 418 800 139 1182
> 79 3407897 2235 30412474 169056 429 137 30 401 702 108 1024
> 80 3407776 1954 30412870 169062 368 127 28 360 634 85 875
> 81 3407665 1728 30413199 169070 304 111 26 299 565 104 760
> 82 3407557 1518 30413510 169077 266 96 22 268 498 94 658
> 83 3407469 1337 30413772 169084 235 81 17 234 436 88 579
> 84 3407398 1179 30413992 169093 196 67 16 222 392 63 502
> 85 3407312 1043 30414208 169099 162 52 11 206 331 60 446
> 86 3407242 939 30414381 169100 135 51 12 188 300 75 376
> 87 3407187 837 30414531 169107 113 42 12 168 269 65 335
> 88 3407119 764 30414669 169110 110 40 11 162 228 62 312
> 89 3407080 686 30414783 169113 109 41 13 143 199 43 301
> 90 3407051 612 30414884 169115 104 38 12 112 175 49 276
> 91 3407023 532 30414987 169120 98 39 9 81 152 37 262
> 92 3406991 476 30415070 169125 92 33 8 73 134 32 237
> 93 3406954 445 30415135 169128 90 30 6 84 119 20 222
> 94 3406926 394 30415209 169133 76 24 3 75 109 19 191
> 95 3406909 348 30415271 169134 65 24 3 60 104 24 160
> 96 3406889 317 30415321 169135 61 26 6 50 104 23 140
> 97 3406869 278 30415380 169135 53 23 5 53 93 18 114
> 98 3406851 247 30415427 169137 44 17 4 45 84 21 97
> 99 3406836 212 30415474 169140 36 14 4 41 71 18 82
> 100 3406822 201 30415498 169141 31 12 4 37 62 19 83
> 101 3406808 180 30415533 169141 30 12 5 34 55 14 77
> 102 3406794 163 30415562 169143 20 6 3 39 45 12 67
> 103 3406783 145 30415590 169144 19 6 3 33 39 13 60
> 104 3406773 133 30415612 169144 16 7 3 29 37 9 58
> 105 3406763 120 30415635 169144 19 7 3 29 35 4 52
> 106 3406757 110 30415649 169146 18 5 1 24 31 10 45
> 107 3406749 104 30415663 169146 17 5 1 17 33 10 44
> 108 3406741 96 30415678 169147 13 4 0 21 29 7 39
> 109 3406738 87 30415690 169147 12 5 1 12 32 8 35
> 110 3406733 79 30415703 169147 14 6 1 10 34 5 30
> 111 3406726 67 30415721 169148 10 3 1 14 25 4 24
> 112 3406719 60 30415735 169148 7 3 1 18 21 3 18
> 113 3406712 61 30415741 169148 7 3 1 18 17 5 21
> 114 3406707 56 30415751 169148 6 2 1 14 16 5 21
> 115 3406701 54 30415759 169148 8 4 2 15 12 6 21
> 116 3406700 50 30415762 169150 8 3 1 10 13 2 25
> 117 3406697 44 30415771 169150 8 3 1 9 11 2 22
> 118 3406693 47 30415772 169150 8 3 1 5 14 4 24
> 119 3406688 45 30415779 169150 7 4 2 10 12 1 22