- Build/Test information:
- Build directory: .
- Parallel run
- Files:
- Dimensionality: 2
- Compilation:
Successful
- Compilation time: 1.045 s
- Compilation command:
cmake --build /home/regtester/git/ExaEpi/builddir -j 8 -- agent
- make output
- Execution:
- Execution time: 126.929 s
- 5 run average: 125.121 s
- Relative performance: 1.4% slower
- Execution command:
mpiexec -n 1 ./CA_July4.ex inputs.ca amr.plot_file=CA_July4_plt amr.check_file=CA_July4_chk amr.checkpoint_files_output=0 agent.census_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CensusData/CA.dat" agent.workerflow_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CensusData/CA-wf.bin" disease.case_filename = "/home/regtester/git/ExaEpi/data/CaseData/July4.cases" agent.plot_int=120 agent.air_travel_int=-1
- execution output
- execution stderr
- Comparison:
/home/regtester/git/amrex/Tools/Plotfile//fcompare.gnu.ex --abort_if_not_all_found -n 0 /home/regtester/RegTesting/rt-ExaEpi/ExaEpi-GPU-benchmarks/plt00120 plt00120
| variable name | absolute error | relative error |
|---|
| | (||A - B||) | (||A - B||/||A||) |
|---|
| level = 0 |
| total | 0.0 | 0.0 |
| never_infected | 130.0 | 0.1130434783 |
| infected | 3.0 | 1.0 |
| immune | 128.0 | 0.06403201601 |
| susceptible | 0.0 | 0.0 |
| new_cases | 0.0 | 0.0 |
| FIPS | 0.0 | 0.0 |
| Tract | 0.0 | 0.0 |
| comm | 0.0 | 0.0 |
| unit | 0.0 | 0.0 |
diff -r /home/regtester/RegTesting/rt-ExaEpi/ExaEpi-GPU-benchmarks//CA_July4_output.dat output.dat
2,121c2,121
< 0 33956257 35405 0 0 0 0 0 35242 65 98 0
< 1 33947185 44477 0 0 36 16 6 38782 2271 3377 47
< 2 33384556 607106 0 0 435 147 30 583710 9376 12149 1871
< 3 32274009 1717652 1 0 1964 672 144 1587798 52028 67235 10591
< 4 32211950 1779692 18 2 9632 3202 633 1248035 213864 267606 50187
< 5 32106352 1884978 329 3 38531 13060 2636 733462 461883 455290 234343
< 6 31912026 2076743 2872 21 89508 30475 6295 493310 634838 347240 601355
< 7 31639548 2333971 17962 181 134537 45992 9672 532763 723827 174044 903337
< 8 31278065 2630280 82505 812 146335 50295 10540 700652 782877 133946 1012805
< 9 30780556 2944877 264292 1937 134328 46713 9826 954080 816018 172196 1002583
< 10 30109410 3272137 607210 2905 128446 44941 9589 1294940 807696 236625 932876
< 11 29242619 3706991 1038662 3390 139929 49221 10613 1712499 800906 321037 872549
< 12 28160435 4405451 1422033 3743 158237 55542 11929 2192161 874250 431541 907499
< 13 26844823 5432882 1709540 4417 170082 59317 12754 2724083 1066430 563642 1078727
< 14 25293962 6739219 1952834 5647 172781 59752 12819 3284548 1366404 712247 1376020
< 15 23525727 8242740 2215804 7391 174800 60028 12791 3841393 1747013 876322 1778012
< 16 21572920 9860659 2548396 9687 180171 61355 13078 4356719 2189400 1042326 2272214
< 17 19495865 11488031 2995231 12535 186725 63412 13430 4775158 2672273 1204347 2836253
< 18 17369258 13018043 3588632 15729 195401 66010 14000 5052867 3174587 1346496 3444093
< 19 15288980 14323348 4360333 19001 207761 69802 14786 5142503 3661458 1455260 4064127
< 20 13334277 15303698 5331314 22373 224099 75061 15811 5025503 4102770 1515201 4660224
< 21 11575986 15873160 6516827 25689 246637 82834 17347 4717578 4452181 1516859 5186542
< 22 10058760 15984380 7919667 28855 273608 92042 19431 4252710 4684360 1456796 5590514
< 23 8792090 15636024 9531548 32000 305134 103055 21864 3692703 4768330 1345316 5829675
< 24 7759206 14869232 11327774 35450 336740 114306 24306 3108584 4693288 1193386 5873974
< 25 6929023 13761806 13261570 39263 366961 125159 26840 2556339 4467081 1023002 5715384
< 26 6270122 12408093 15269816 43631 393488 135071 29056 2065955 4119204 849790 5373144
< 27 5746708 10912109 17284158 48687 413410 142799 31055 1651078 3681111 693264 4886656
< 28 5329876 9378341 19228763 54682 424587 147075 32068 1316507 3196505 556878 4308451
< 29 4995073 7903780 21031439 61370 427766 148514 32407 1050919 2708108 442851 3701902
< 30 4725209 6554140 22643511 68802 421694 146715 32005 841872 2247993 353289 3110986
< 31 4506665 5368435 24039662 76900 406550 141674 30834 678121 1836822 282033 2571459
< 32 4328193 4361714 25216432 85323 384287 133980 29251 549022 1484838 227045 2100809
< 33 4180066 3532202 26185372 94022 355960 123979 27047 449115 1193119 183044 1706924
< 34 4057822 2859279 26971942 102619 323793 112576 24571 369828 957173 148446 1383832
< 35 3956722 2319421 27604769 110750 289629 100766 21977 305250 769702 122370 1122099
< 36 3871827 1889249 28112256 118330 255182 88861 19503 253879 621423 100771 913176
< 37 3800612 1546655 28519064 125331 222568 77449 16989 211581 504496 83503 747075
< 38 3741192 1271834 28847121 131515 192024 66784 14708 177159 412225 69422 613028
< 39 3691041 1051040 29112615 136966 164565 57185 12530 148701 338588 58330 505421
< 40 3648699 872407 29328807 141749 140637 49036 10722 125055 279386 48697 419269
< 41 3612808 726568 29506448 145838 119410 41853 9138 105600 231743 40768 348457
< 42 3582391 607648 29652356 149267 101849 35618 7780 89202 193214 34505 290727
< 43 3556641 509295 29773511 152215 86388 30205 6574 75489 161631 29072 243103
< 44 3534715 428823 29873397 154727 73391 25657 5567 64270 135881 24502 204170
< 45 3516049 361285 29957494 156834 62655 21900 4716 54446 114117 20784 171938
< 46 3500123 305708 30027197 158634 53393 18613 4024 46496 96375 17576 145261
< 47 3486566 258625 30086325 160146 45569 15860 3428 39391 81568 15137 122529
< 48 3475044 219334 30135832 161452 39045 13550 2889 33490 68993 12839 104012
< 49 3465141 186261 30177709 162551 33509 11699 2469 28627 58526 10866 88242
< 50 3456526 158657 30213029 163450 28826 10088 2150 24639 49846 9274 74898
< 51 3449251 135159 30243010 164242 24625 8560 1831 21141 42522 7882 63614
< 52 3443006 115380 30268396 164880 21137 7372 1592 18163 36298 6797 54122
< 53 3437672 98469 30290046 165475 18164 6284 1333 15525 30961 5901 46082
< 54 3433046 84315 30308320 165981 15703 5396 1136 13316 26530 4955 39514
< 55 3429165 72053 30324039 166405 13609 4642 993 11439 22607 4325 33682
< 56 3425812 61528 30337536 166786 11674 3965 841 9728 19366 3636 28798
< 57 3422870 52851 30348876 167065 10190 3485 736 8333 16558 3162 24798
< 58 3420386 45455 30358497 167324 8848 3069 652 7192 14195 2633 21435
< 59 3418198 39061 30366860 167543 7647 2665 591 6290 12257 2256 18258
< 60 3416347 33637 30373946 167732 6541 2320 524 5458 10516 1956 15707
< 61 3414749 28849 30380143 167921 5570 1981 466 4640 9053 1663 13493
< 62 3413401 24720 30385468 168073 4800 1696 382 3903 7779 1511 11527
< 63 3412174 21251 30390026 168211 4116 1453 329 3437 6654 1228 9932
< 64 3411147 18258 30393946 168311 3542 1242 281 2944 5695 1076 8543
< 65 3410250 15655 30397354 168403 2989 1034 239 2574 4944 932 7205
< 66 3409424 13605 30400143 168490 2542 864 188 2305 4265 794 6241
< 67 3408805 11738 30402554 168565 2239 756 157 1907 3727 705 5399
< 68 3408235 10123 30404690 168614 1912 657 139 1645 3206 572 4700
< 69 3407773 8712 30406513 168664 1703 573 124 1382 2759 506 4065
< 70 3407330 7523 30408098 168711 1470 485 99 1222 2415 416 3470
< 71 3406955 6484 30409472 168751 1230 409 89 1066 2138 353 2927
< 72 3406636 5630 30410620 168776 1058 366 82 900 1857 355 2518
< 73 3406361 4826 30411673 168802 922 318 68 776 1559 313 2178
< 74 3406096 4181 30412549 168836 761 248 47 686 1364 254 1877
< 75 3405851 3686 30413266 168859 682 230 41 645 1172 224 1645
< 76 3405678 3168 30413936 168880 572 197 32 575 979 199 1415
< 77 3405521 2749 30414503 168889 495 167 31 444 857 198 1250
< 78 3405386 2418 30414959 168899 468 158 28 384 752 154 1128
< 79 3405272 2080 30415402 168908 414 140 26 318 639 122 1001
< 80 3405162 1790 30415794 168916 364 126 25 298 552 98 842
< 81 3405071 1569 30416096 168926 328 118 26 267 474 98 730
< 82 3404987 1384 30416360 168931 293 101 26 228 424 76 656
< 83 3404915 1198 30416613 168936 264 95 26 197 364 66 571
< 84 3404858 1030 30416832 168942 225 84 21 169 303 64 494
< 85 3404803 882 30417024 168953 189 67 14 149 265 54 414
< 86 3404751 772 30417182 168957 159 57 13 124 241 51 356
< 87 3404709 686 30417304 168963 142 48 8 113 214 46 313
< 88 3404669 614 30417413 168966 118 39 7 109 195 33 277
< 89 3404634 537 30417519 168972 105 39 5 93 172 25 247
< 90 3404610 459 30417619 168974 89 38 6 72 158 32 197
< 91 3404578 413 30417696 168975 80 30 5 72 137 37 167
< 92 3404560 353 30417773 168976 68 29 6 62 117 20 154
< 93 3404537 304 30417845 168976 57 25 5 60 95 15 134
< 94 3404527 263 30417895 168977 55 25 6 48 79 11 125
< 95 3404508 239 30417935 168980 48 20 4 44 70 11 114
< 96 3404494 214 30417971 168983 38 12 2 37 65 14 98
< 97 3404484 188 30418006 168984 42 14 3 32 55 14 87
< 98 3404474 165 30418039 168984 36 13 3 33 47 7 78
< 99 3404467 145 30418064 168986 28 9 2 25 46 8 66
< 100 3404456 130 30418089 168987 24 9 1 24 42 6 58
< 101 3404446 109 30418119 168988 20 6 1 20 39 5 45
< 102 3404440 99 30418135 168988 21 7 1 17 36 8 38
< 103 3404431 96 30418147 168988 19 8 1 17 36 7 36
< 104 3404425 89 30418159 168989 16 7 0 16 35 5 33
< 105 3404415 87 30418171 168989 14 7 0 21 33 4 29
< 106 3404411 77 30418184 168990 13 7 0 19 27 5 26
< 107 3404409 66 30418197 168990 9 6 0 9 29 7 21
< 108 3404404 59 30418209 168990 6 5 0 8 23 7 21
< 109 3404396 56 30418219 168991 6 4 0 14 18 5 19
< 110 3404392 54 30418223 168993 4 2 0 15 18 0 21
< 111 3404388 49 30418231 168994 4 1 0 15 15 3 16
< 112 3404388 40 30418239 168995 4 0 0 6 12 5 17
< 113 3404386 34 30418247 168995 3 0 0 4 13 2 15
< 114 3404385 30 30418252 168995 4 0 0 3 14 1 12
< 115 3404383 25 30418259 168995 3 0 0 4 10 0 11
< 116 3404381 25 30418261 168995 3 0 0 6 9 0 10
< 117 3404380 23 30418264 168995 2 0 0 5 10 1 7
< 118 3404379 18 30418270 168995 1 0 0 2 9 3 4
< 119 3404377 16 30418274 168995 1 0 0 4 5 2 5
---
> 0 33953557 38105 0 0 0 0 0 37941 73 91 0
> 1 33944523 47139 0 0 14 4 1 41150 2453 3499 37
> 2 33312915 678747 0 0 296 114 26 653438 10159 13141 2009
> 3 32266495 1725166 1 0 1579 523 121 1582290 57167 74324 11385
> 4 32203000 1788648 14 0 9978 3391 721 1225786 225956 281852 55054
> 5 32091050 1900289 321 2 40527 13891 2871 723655 471328 454255 251051
> 6 31888899 2099843 2902 18 92163 31447 6621 500446 640521 339653 619223
> 7 31604729 2367326 19409 198 135717 46306 9723 552308 729637 172688 912693
> 8 31227257 2675723 87831 851 146384 50256 10645 730299 790230 137290 1017904
> 9 30707192 3004967 277522 1981 134556 46808 10053 996620 823691 179397 1005259
> 10 30004271 3357158 627335 2898 129469 45629 9939 1354124 818328 246800 937906
> 11 29098229 3831012 1058991 3430 141293 49799 10860 1791016 819298 335921 884777
> 12 27974998 4572920 1439923 3821 159376 55931 12165 2284925 904216 451595 932184
> 13 26617659 5642191 1727301 4511 170756 59798 12936 2822648 1110747 588703 1120093
> 14 25029808 6981094 1975042 5718 173408 60243 12994 3381884 1423425 741450 1434335
> 15 23234737 8501996 2247438 7491 175994 60650 13008 3926424 1815102 903809 1856661
> 16 21271206 10115576 2594956 9924 181496 61965 13182 4414351 2266022 1068665 2366538
> 17 19200283 11717597 3060910 12872 188691 64186 13713 4797258 2754298 1225798 2940243
> 18 17094109 13199440 3682039 16074 197764 67073 14275 5039443 3251212 1359615 3549170
> 19 15048521 14437509 4486187 19445 210587 71220 15105 5091857 3727345 1454462 4163845
> 20 13134342 15340511 5493989 22820 228155 77135 16315 4946080 4148598 1506571 4739262
> 21 11416873 15833668 6714991 26130 251268 84804 18000 4624567 4476790 1497221 5235090
> 22 9932630 15874820 8154945 29267 278183 94153 19943 4161396 4678092 1432669 5602663
> 23 8694748 15469552 9794892 32470 308910 105156 22376 3611433 4735911 1316771 5805437
> 24 7684878 14663732 11607002 36050 340637 116183 24820 3039328 4639134 1167734 5817536
> 25 6870723 13539962 13541028 39949 370918 127044 27194 2501668 4401293 999459 5637542
> 26 6222372 12182291 15542463 44536 395745 135801 29195 2024367 4043973 833702 5280249
> 27 5706233 10701026 17534649 49754 414223 142584 30743 1622746 3608216 679382 4790682
> 28 5292773 9198258 19444896 55735 424920 146700 31693 1298800 3131920 546078 4221460
> 29 4960763 7754935 21213315 62649 426678 147670 32104 1039178 2652337 436676 3626744
> 30 4692908 6434777 22793796 70181 419619 145586 31650 834544 2201830 349331 3049072
> 31 4475428 5277576 24160424 78234 403895 140583 30669 672919 1801348 280519 2522790
> 32 4298072 4296100 25310808 86682 381285 132869 29043 545166 1459579 225721 2065634
> 33 4151881 3484870 26259750 95161 352884 123241 26899 444908 1175434 182112 1682416
> 34 4032495 2824216 27031366 103585 320801 112152 24631 364240 944743 148063 1367170
> 35 3933450 2292915 27653568 111729 286909 100529 22100 299514 760798 121403 1111200
> 36 3851441 1866771 28154138 119312 253388 88641 19425 247555 613529 99351 906336
> 37 3783201 1526404 28555718 126339 220775 77296 16861 204946 498214 81370 741874
> 38 3726547 1251448 28881096 132571 190513 66753 14505 170252 405996 67197 608003
> 39 3678689 1030734 29144234 138005 163142 57042 12360 141951 332700 55824 500259
> 40 3638340 852008 29358591 142723 139183 48762 10530 119342 273373 46588 412705
> 41 3604777 705776 29534273 146836 118222 41451 8861 99946 225569 38973 341288
> 42 3575968 587041 29678381 150272 100255 35148 7541 84247 187079 32635 283080
> 43 3551700 490562 29796189 153211 85123 29749 6431 71199 156086 27433 235844
> 44 3530745 410633 29894590 155694 72091 25169 5474 60771 130035 22977 196850
> 45 3512909 344976 29976046 157731 61049 21373 4696 51965 108880 19592 164539
> 46 3497662 290976 30043538 159486 51863 18180 4062 44135 91758 16886 138197
> 47 3484589 246019 30100038 161016 44301 15423 3431 37961 77343 14427 116288
> 48 3473407 208557 30147441 162257 37713 13124 2983 32333 65508 12373 98343
> 49 3463655 177816 30186881 163310 32167 11169 2534 27907 55583 10688 83638
> 50 3455191 152117 30220129 164225 27552 9602 2147 24076 47344 9226 71471
> 51 3448078 129972 30248627 164985 23654 8239 1827 20595 40441 7795 61141
> 52 3442013 111278 30272718 165653 20324 7058 1494 17675 34612 6785 52206
> 53 3436682 95203 30293587 166190 17468 6092 1314 15285 29524 5777 44617
> 54 3432118 81898 30310980 166666 15079 5261 1130 13184 25426 4876 38412
> 55 3428177 70365 30326051 167069 13026 4544 950 11347 21917 4199 32902
> 56 3424759 60622 30338858 167423 11414 3953 831 9834 18944 3617 28227
> 57 3421905 52074 30349960 167723 9782 3410 732 8358 16369 3116 24231
> 58 3419499 44654 30359525 167984 8416 2938 626 7123 14175 2643 20713
> 59 3417297 38675 30367486 168204 7347 2569 557 6137 12300 2300 17938
> 60 3415375 33232 30374666 168389 6321 2212 488 5386 10496 1988 15362
> 61 3413816 28615 30380671 168560 5418 1939 424 4595 9075 1793 13152
> 62 3412421 24578 30385975 168688 4636 1698 384 3964 7681 1566 11367
> 63 3411186 21190 30390473 168813 4037 1462 345 3435 6622 1356 9777
> 64 3410157 18207 30394371 168927 3510 1249 294 2953 5640 1145 8469
> 65 3409273 15772 30397591 169026 3110 1088 256 2537 4876 969 7390
> 66 3408477 13589 30400469 169127 2678 936 208 2270 4110 817 6392
> 67 3407837 11678 30402949 169198 2343 800 177 1900 3562 715 5501
> 68 3407294 10138 30404978 169252 2044 694 157 1606 3120 586 4826
> 69 3406760 8875 30406712 169315 1823 600 126 1423 2688 519 4245
> 70 3406326 7621 30408352 169363 1547 521 99 1280 2286 454 3601
> 71 3405957 6569 30409733 169403 1325 428 77 1060 1998 411 3100
> 72 3405625 5655 30410955 169427 1115 384 68 919 1754 351 2631
> 73 3405347 4894 30411966 169455 952 338 64 779 1509 307 2299
> 74 3405088 4238 30412856 169480 828 284 58 719 1289 254 1976
> 75 3404871 3683 30413603 169505 709 231 46 628 1145 216 1694
> 76 3404673 3188 30414282 169519 606 200 43 530 1001 202 1455
> 77 3404499 2789 30414847 169527 543 181 40 477 869 176 1267
> 78 3404371 2429 30415320 169542 457 153 34 393 795 165 1076
> 79 3404221 2152 30415736 169553 406 140 35 360 709 138 945
> 80 3404105 1907 30416084 169566 362 123 26 336 629 107 835
> 81 3404011 1644 30416434 169573 312 105 20 297 522 99 726
> 82 3403931 1422 30416724 169585 273 93 16 228 455 96 643
> 83 3403849 1238 30416983 169592 242 80 16 203 385 90 560
> 84 3403795 1082 30417189 169596 222 77 18 170 339 68 505
> 85 3403725 954 30417379 169604 204 71 14 155 290 66 443
> 86 3403683 838 30417529 169612 167 56 9 130 266 54 388
> 87 3403631 735 30417680 169616 148 51 10 122 231 46 336
> 88 3403602 624 30417818 169618 129 48 8 109 187 34 294
> 89 3403576 539 30417925 169622 99 37 5 88 162 38 251
> 90 3403555 466 30418013 169628 85 29 3 67 146 19 234
> 91 3403525 396 30418111 169630 67 24 3 68 123 20 185
> 92 3403506 333 30418192 169631 65 23 3 62 96 13 162
> 93 3403479 299 30418252 169632 53 19 2 63 91 12 133
> 94 3403462 270 30418297 169633 47 15 1 48 83 17 122
> 95 3403451 238 30418338 169635 40 12 1 35 76 23 104
> 96 3403432 211 30418384 169635 38 15 2 38 67 16 90
> 97 3403421 187 30418418 169636 37 15 3 35 59 15 78
> 98 3403411 167 30418448 169636 36 14 2 27 54 16 70
> 99 3403400 143 30418482 169637 28 10 1 29 48 11 55
> 100 3403389 137 30418498 169638 32 11 1 30 42 12 53
> 101 3403384 118 30418521 169639 31 11 1 26 35 7 50
> 102 3403382 110 30418531 169639 29 10 1 17 36 8 49
> 103 3403374 102 30418547 169639 30 12 1 14 30 6 52
> 104 3403369 87 30418565 169641 23 8 0 13 25 3 46
> 105 3403368 72 30418581 169641 18 5 0 9 22 2 39
> 106 3403365 62 30418593 169642 13 4 0 10 17 2 33
> 107 3403362 48 30418610 169642 11 3 0 7 16 2 23
> 108 3403357 45 30418617 169643 10 2 0 9 13 1 22
> 109 3403357 39 30418623 169643 10 2 0 7 11 2 19
> 110 3403355 31 30418633 169643 6 0 0 5 11 2 13
> 111 3403354 27 30418638 169643 4 0 0 4 10 2 11
> 112 3403353 26 30418640 169643 5 1 0 3 9 0 14
> 113 3403352 21 30418646 169643 4 2 0 2 7 2 10
> 114 3403352 18 30418649 169643 2 2 0 1 7 2 8
> 115 3403349 14 30418656 169643 1 0 0 3 4 3 4
> 116 3403346 14 30418659 169643 1 0 0 5 2 1 6
> 117 3403345 13 30418661 169643 1 0 0 5 2 1 5
> 118 3403345 10 30418664 169643 2 1 0 1 3 2 4
> 119 3403343 12 30418664 169643 3 2 1 2 4 0 6